Journal: 遗传.2010,32: 1175-1186
Author: 陈洁, 林海建, 潘光堂, 张志明, 张彪, 沈亚欧, 覃成, 张谦, 赵茂俊
Abstract:
microRNA (miRNA)是一类具有20~24 nt 核苷酸长度的非蛋白质编码的内源小分子RNA, 它在植物生长发育和逆境胁迫响应等过程中发挥着重要作用。文章利用基于Illumina/Solexa原理的小分子RNA深度测序技术, 结合生物信息学的方法对玉米根系和叶片中已知miRNA的类型、丰度及靶基因进行了分析。研究发现, 在根系中共检测到92个已知的miRNA, 分别属于18个miRNA家族, 其表达丰度在1~105 943之间; 在叶片中, 共发现86个已知的miRNA, 分别属于17个miRNA家族, 其表达丰度在1~85 973之间。靶基因预测结果表明, 根系中的18个miRNA家族共靶向54个蛋白, 进一步的功能预测发现, 这些基因涉及了转录调控、物质能量代谢、电子传递、胁迫响应和信号转导等过程。以上研究结果表明, 就已知的miRNA而言, 无论是miRNA的类型还是表达丰度, 在玉米根系和叶片中都存在较大差异。
Link: http://www.chinagene.cn/Jwk_yc/CN/abstract/abstract20548.shtml